若公司發現因交換貨物而漏開發票，應儘速向「所轄國稅局」辦理補報補繳。根據稅捐稽徵法第48條之1，只要在未經檢舉、未經調查前主動補報，僅需補繳稅款並加計利息，即可免除罰鍰。建議聯繫公司所在地的國稅局銷售稅組，或撥打國稅局諮詢專線（如臺北國稅局銷售稅組：02-23113711 分機1760）詢問具體辦理流程。