這項規定最容易被忽略的地方是：房地合一稅的申報義務，並不等於「有稅才要申報」。只要出售的是105年1月1日以後取得的房屋或土地，無論交易獲利、虧損，或最後沒有應納稅額，都要在所有權移轉登記次日起30日內自行申報。制度上，申報是讓稽徵機關確認交易結果與適用情形的程序；是否需要繳稅，則是在申報後依資料核定的結果。把兩件事分開設計，可避免只靠當事人自行判斷「我沒有賺錢」而出現資料落差。
要求虧損交易也申報，對納稅人不只有義務，也關係到權益。經核定的交易虧損，可以在交易日後3年內，自其他房地交易所得中減除；但若未完成申報，就可能失去讓虧損被核定、後續主張扣除的基礎。因此，申報不應只被理解為行政負擔，也是保留稅務權利的必要步驟。
一般人出售符合條件的房地時，應先把30日期限列入交易流程，並準備契約書影本及相關文件；如有課稅所得，還要檢附繳稅收據。尤其不要以「沒有獲利」取代正式申報判斷，因為逾期即使最後認定虧損，仍可能遭處3,000元至30,000元罰鍰。若已錯過期限，在未被檢舉或調查前主動補報、補繳並加計利息，則可免予處罰。